这部集神话、童话、传奇于一体的大型动画连续剧，讲述了小英雄哪吒成长的故事。大魔头石矶潜伏千年，伺机向正义力量反扑，她帮助残暴的纣王镇压天下的民众。正义力量期待着一个英雄的诞生，而石矶为了自己的阴谋，开始不断指使她的爪牙申公豹除掉哪吒。哪吒尚未出生，就不断遭遇危险，出生后，更是在一种异乎寻常的环境中奇迹般地成长起来。但是，在父母兄弟的身边，他一直都很快乐。
由于申公豹的挑拨，哪吒离家出走，下海寻找神秘人。他和小龙女结为好友，共同闯荡海底。东海至宝龙珠被盗，哪吒被龙宫误会，被认做盗宝人。他一气之下，大闹龙宫，打伤龙子，与龙王结下深仇。四海龙王水淹陈塘关，哪吒为不牵累他人，毅然自杀。在女娲、太乙、小龙女的帮助下，哪吒复活，并获得更强大的神力。他与龙王冰释前嫌，共同对付大魔头石矶。但是由于太过急躁，石矶溜了。
石矶和纣王达成秘密协定，她将太阳固定起来，让纣王作威作福，而纣王则把大地的命脉“龙脉”交给了她。哪吒争取到巨人夸父的帮助，使太阳恢复正常。这时，来自西岐的姜子牙企图把他们的王子姬发从朝歌救出来。哪吒帮助姬发逃出监牢，还大闹皇宫，把纣王搅得不得安宁。但是，他自己也遇到了很多危险，落入地下水牢，放出石头怪兽，还险遭申公豹的毒手。更大的危险是，龙脉已经被石矶吸食很多，天下即将大乱。
就在千钧一发的时刻，哪吒与石矶拼死相争，保护龙脉。天崩地裂，龙脉分成了两块盘古石，哪吒坠入岐山山谷，只拿到一块。只有把两块合在一起，天下才可能安定。石矶派杨戬来盗取盘古石，杨戬却和哪吒、山鬼等人不打不相识，交上了朋友。哪吒到炎山弱水追击石矶，受伤失去了全部功力。他在朋友们的帮助下，深入神奇山谷，经历一连串的危险，最终恢复力量，还得到了宝物“风火轮”。
哪吒打败了四大妖怪魑魅魍魉，结识了不可思议的大神共工，冒生命危险救出小龙女。在一个月蚀之夜，哪吒终于击败了石矶。
此时，西岐姬发率领队伍讨伐纣王，哪吒作为先行官，一路上降妖除魔，还要对付在暗中作恶的石矶。他既结识了土行孙这样的朋友，还学到了不少东西。义军终于攻破朝歌，结束了纣王的残暴统治，和平与幸福即将来临。
但是，石矶的毒计也成功了，她把哪吒拖入了一个大圈套……哪吒要凭着无比的毅力和智慧，才能最终赢得胜利。

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